При создании документа, мы можем учесть ставку НДС с помощью кнопки "переключателя". Ставка НДС просчитается автоматически. 

Пример отображения кнопки "переключателя" ставки НДС в документе "Чеки": 

Пример отображения кнопки "переключателя" ставки НДС в документе "Заказ-счет на оплату от поставщика":